Basel - Das Biotechunternehmen Genedata stellt eine neue Analyseplattform für die DNA von Saatgut vor. Genedata Selector 10 enthält einen web-basierten Workflow-Editor, mit dem sich Zuchtdaten von Samen mit Datenbanken abgleichen und skalieren lassen. Der Editor ist mit der Software Nextflow kompatibel.
Genedata, ein in Basel ansässiges Unternehmen im Bereich der Biotechnologie, hat eine neue Plattform zur Analyse von Erbsequenzen vorgestellt. Mit Genedata Selector 10 lassen sich Datensätze von Saatgut-DNA web-basiert vergleichen und skalieren, heisst es in einer Mitteilung. Das Programm ermöglicht es Forschenden, ganze Arbeitsabläufe zu automatisieren und eine grosse Menge von Datensätzen zu analysieren. Die benutzerfreundliche Oberfläche gestattet Wissenschaftlern mit verschiedenem Kenntnisstand auf dem Gebiet der Bioinformatik, mit dem Editor zu arbeiten. Dabei erlaubt die Methode des Next Generation Sequencing (NGS), in kürzerer Zeit als mit bisherigen Verfahren Basensequenzen von DNA auszulesen.
Die Plattform verfügt über eine Vielzahl von Programmbausteinen, sogenannten Playbooks, deren individuell möglicher Einsatz eine schnelle Analyse von Genomsequenzen und einen Abgleich mit vorhandenen Datenbanken gestattet. Der Genedata Selector 10 ist mit der Programmablauf-Software Nextflow kompatibel.
„Die neueste Version von Genedata Selector beschleunigt die Entwicklung innovativer landwirtschaftlicher Biotechnologieprodukte, indem sie Forschungs- und Entwicklungsorganisationen in die Lage versetzt, die Leistungsfähigkeit von NGS zu nutzen, um zu globalen Fortschritten in der Ernährung und Nachhaltigkeit beizutragen“, wird Othmar Pfannes, CEO von Genedata, in der Mitteilung zitiert. ce/ww
